Identification of Species of the Mycobacterium Genus Associated with Pulmonary and Extrapulmonary Infection

Main Article Content

Misleidis Sardiñas Aragón
Grechen Caridad García León
https://orcid.org/0009-0007-6042-3725
María Rosarys Martínez Romero
https://orcid.org/0009-0003-9610-9886
Raúl Díaz Rodriguez
https://orcid.org/0009-0006-9835-9733
Lilian María Mederos Cuervo

Abstract

Introduction: The significant increase in mycobacterial species described as pathogenic agents implied the need to implement more advanced identification methods that would shorten the diagnostic time. From a clinical point of view, it is important to differentiate Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) from the rest of the nontuberculous mycobacterial species (NTM), in order to apply specific treatment. 


Objective: The objective of this study is to identify mycobacterial isolates from pulmonary and extrapulmonary clinical samples using the SD BIOLINE TB Ag MPT64 and Genotype Mycobacterium CM/AS diagnostic techniques. 


Materials and methods: 3,604 clinical samples were received from symptomatic patients during the period between January 2018-January 2024. These were processed at the National Reference and Research Laboratory for Tuberculosis, Leprosy and Mycobacteria of the “Pedro Kourí” Institute of Tropical Medicine (IPK). For the identification of MTBC, the SD TB Ag MPT64 immunochromatographic test was used, and for the identification of NTM, the Genotype Mycobacterium CM/AS molecular diagnostic techniques were used. 


Results: Of the total samples processed, 325 mycobacterial isolates were obtained; 252 (77.53%) identified as MTBC and 73 (22.45%) nontuberculous mycobacterial species, of which the highest frequency of isolation was: Mycobacterium fortuitum 19 (26.02%), Mycobacterium avium 17 (23. 80%) and Mycobacterium intracellulare13 (17.80%). 


Conclusions: The results obtained reaffirm that the diagnostic methods used are adequate, both techniques achieve a shortening of the diagnostic time, which allows the early implementation of the appropriate treatment, thus avoiding the spread of the infection, especially in patients with some type of deterioration in their barrier immunological.

Downloads

Download data is not yet available.

Article Details

How to Cite
Sardiñas Aragón, M., García León, G. C., Martínez Romero, M. R., Díaz Rodriguez, R., & Mederos Cuervo, L. M. (2024). Identification of Species of the Mycobacterium Genus Associated with Pulmonary and Extrapulmonary Infection. Respirar, 16(4), 3656–372. https://doi.org/10.55720/respirar.16.4.4
Section
Artículos Originales

References

Tiberi S, Carvalho AC, Sulis G et al. The cursed duet today: Tuberculosis and HIV-coinfection. Presse Med 2017;46: e23–e39.

Farfán-Cano GG, Farfán Cano SG, Farfán Cano HR, Silva Rojas GA. Infecciones oportunistas asociadas a VIH. Rev Cien Ec 2022;4(4):1. Doi: 10.23936/cienec.v4i4.71.

Cabello-Vílchez AM, Núñez-Ato RG. Aislamiento y Caracterización Molecular de Micobacterias No Tuberculosas en el Sistema de distribución de agua en un Hospital de Lima (Perú). Bio salud 2018;17(2):42-50. Doi: 10.17151/biosa.2018.17.2.1

Cabello Vílchez AM, Núñez Ato RG. Aislamiento y caracterización molecular de micobacterias no tuberculosas en el sistema de distribución de agua en un hospital de lima (Perú). Bio Salud 2018;17(2):7 – 24.

Esteban J, Navas E. Tratamiento de las infecciones producidas por micobacterias no tuberculosas. Enferm Infecc Microbiol Clin 2018;36(9):586–92.

Gitti Z, Neonakis I, Fanti G, Kontos F, Maraki S, Tselentis Y. Use of the GenoType Mycobacterium CM and AS Assays To Analyze 76 Nontuberculous Mycobacterial Isolates from Greece. J Clin Microbiol 2006;44(6): 2244–6. Doi: 10.1128/JCM.02088-05.

Yu MC, Chen HY, Wu MH, Huang WL, Kuo YM, Yu FL. Evaluation of the rapid MGITTM TBc Identification test for culture confirmation of Mycobacterium tuberculosis complex strains. J Clin Microbiol 2011; 49:802–7. Doi: 10.1128/JCM.02243-10.

García Soler P, Nuñez Cuadro E, Milano Manso G, Ruíz Sanchez P. Identificación de Mycobacterium tuberculosis por inmunocromatografía a partir de cultivos sólidos. Enferm Infecc Microbiol Clin 2011; 29(9):706–713.

Kumar V, Tejashree A, Ranganath R. MPT64 Antigen detection for Rapid confirmation of Mycobacterium tuberculosis isolates. BMC Research Notes 2011; 4:79. Doi: 10.1186/1756-0500-4-79.

Jyoti A, Kumar G, Kumar A, Bhalla M, Sarin R, Prasad V. Utility of MPT64 Antigen Detection for Rapid Confirmation of Mycobacterium tuberculosis complex. J Glob Infect Dis 2015;7(2):66–69. Doi: 10.4103/0974-777X.154443.

Leiva C. Evaluación de una técnica de hibridación reversa para identificación rápida de micobacterias en Chile. Rev Chil Enf Respir 2012; 28:9-15. Doi: 10.4067/S0717-73482012000100002

GenoType Mycobacterium CM VER 2.0. [Internet]. [Consultado 15 mar 2023]. Disponible en: www.hain-lifescience.de.

GenoType Mycobacterium AS VER 1.0. [Internet]. [Consultado 15 mar 2023]. Disponible en: www.hain-lifescience.de.

ORAS – CONHU. Manual para el diagnóstico bacteriológico de la tuberculosis. Parte 2: Manual de actualización del cultivo, Lima, Perú. 2018. [Internet]. [Consultado 15 mar 2023] Disponible en: https://www.paho.org/es/documentos/manual-para-diagnosticobacteriologico-tuberculosis-parte-2-manual-actualizacion.

Shenoy V, Mukhopadhyay C. Rapid Immunochromatographic Test for the Identification and Discrimination of Mycobacterium tuberculosis Complex Isolates from Non-tuberculous Mycobacteria. J Clin Diagn Res 2014; 8(4): DC13-DC15. Doi: 10.7860/JCDR/2014/7098.4253

Llerena C, Valbuena A, Zabaleta AP. Micobacteriosis identificadas en el Laboratorio Nacional de Referencia de Colombia entre 2012 y 2016. Biomédica 2018;38(2). Doi: 10.7705/biomedica.v38i0.4143

Mederos LM, Sardiñas M, García GC, Martínez MR, Díaz R. Identificación de especies micobacterianas ambientales u oportunistas en pacientes sintomáticos y con VIH/sida. Salud (i) Ciencia 2020; 24(2):12-18.

Mederos LM, Sardiñas M, García G et al. Importancia diagnóstica de las infecciones genitourinarias producidas por el género Mycobacterium procedentes de pacientes sintomáticos y viviendo con VIH/sida. Rev CENIC Cienc Biol 2021;52 (2):137-145.

Auld S, StaitiehB. HIV and the tuberculosis “set point”: how HIV impairs alveolar macrophage responses to tuberculosis and sets the stage for progressive disease. Retrovirology 2020; 17(1):1–12.

Esteban J. Epidemiología (frecuencia, distribución, hábitat, transmisión) y aspectos microbiológicos y taxonómicos de las micobacterias no tuberculosas. Rev Enf Emerg 2019; 18(3):131-134.

Falkinham J. Ecology of Nontuberculous Mycobacteria. Microorganisms 2021; 9:2262. Doi: 10.3390/microorganisms9112262.

Losa JE. Enfermedades infecciosas emergentes: una realidad asistencial. Ann Sist Sanit Navar 2021; 44(2):147-151.

Herrero T, Sanjoaquin MI, La fuente M, Cabrera LM, Betrán M, Camón AM. Análisis de la incidencia y epidemiología de las infecciones por micobacterias no tuberculosas en el área de salud III de la comunidad autónoma de Aragón. Rev Esp Quimioter. 2023; 36(5): 492–497.

Martínez S, Cano A, Sota LA. Micobacterias no tuberculosas. ¿Una amenaza emergente? Arch Bronconeumol 2017; 53(10):554–560. Doi: 10.1016/j.arbres.2017.02.014

García Coca M, Rodriguez Sevilla G, Muñoz Egea MC, Perez Jorge C, Carrasco Anton N, Esteban J. Historical evolution of the diseases caused by non-pigmented rapidly growing mycobacteria in a University Hospital. Rev Esp Quimioter 2019;32(5): 451-457.

Sosa L, Silva A, Rivera E. Infección por Mycobacterium fortuitum en cirugía plástica. Tratamiento exitoso con claritromicina y levofloxacino durante 12 semanas. Enf Inf Microbiol 2019; 39(4):123-128.

Kumar C, Shrivastava K, SinghA, Chauhan V, Varma M. Skin and Soft‑Tissue Infections Due to Rapidly Growing Myco­bacteria: An Overview. Int J Mycobacteriol 2021;10(3):293-300. Doi: 10.4103/ijmy.ijmy_110_21.

Mederos Cuervo LM, Rodríguez Delgado F, Pomier Suárez O et al. Micobacteriosis en el tracto orofaríngeo en un paciente inmunocompetente. Salud(i)Ciencia 2016;22:57-60.

Mederos LM, Sardiñas M, García G, Martínez MR, Díaz R. Linfadenitis por Mycobacterium en pacientes inmunocompetentes y viviendo con VIH/sida. Rev Cuba Med Tropical 2022;74(1):e768.

Sardiñas M, Mederos LM, García G, Martínez, MR, Lemus D, Díaz R. Identificación rápida de Micobacterias no tuberculosas en Cuba por las técnicas GenoType Mycobacterium CM/AS. Neumol Cir Torax 2019;78 (3): 290-295. Doi: 10.35366/NT193E.

Sardiñas Aragón M, Mederos Cuervo LM, García León G, Martínez Romero MR. Identificación rápida del Complejo Mycobacterium avium a partir de aislados utilizando Genotype Mycobacterium CM. Convención de Salud 2022. [Internet]. [Consultado 15 mar 2023]. Disponible en: https://convencionsalud.sld.cu.

Most read articles by the same author(s)